Молога — город, располагавшийся при впадении реки Мологи в Волгу и затопленный Рыбинским водохранилищем.
Молога находилась в 32 км от Рыбинска и в 120 км от Ярославля в местности богатой водами, при слиянии реки Мологи с Волгой. Ширина Мологи против города составляла 277 м, глубина от 3 до 11 м. Ширина Волги была до 530 м, глубина от 2 до 9 м. Сам город находился на довольно значительной и ровной возвышенности и тянулся по правому берегу Мологи и по левому Волги. До железнодорожных сообщений, причём Молога осталась в стороне от них, пролегал здесь оживлённый Петербургский почтовый тракт.
К городу с XVII века причислялась слобода Горькая Соль (по названию протекающей поблизости речки), отстоящая от города на 13 км вверх по реке Мологе. Тотчас за городом начиналось болото и затем озеро (около 2,5 км в диаметре), называемое Святым. Из него в реку Мологу тёк небольшой ручеёк, носящий название Копь.
14 сентября 1935 года СНК СССР и ЦК ВКП(б) приняли постановление о начале строительства Рыбинского и Угличского гидроузлов. По первоначальному проекту подпорный уровень (высота зеркала воды над уровнем моря) Рыбинского водохранилища должен был составлять 98 м. 1 января 1937 года эта цифра была изменена на 102 м, что увеличивало количество затапливаемых земель почти вдвое. Увеличение подпорного уровня было связано с тем, что эти 4 метра позволяли увеличить мощность выработки Рыбинской ГЭС с 220 до 340 МВт. Город Молога лежал на отметке 100 м над уровнем моря, и именно эти 4 метра стоили ему жизни.
Основное переселение мологжан, в основном в Рыбинск, началось весной 1937 года и длилось четыре года. В период вынужденного переселения некоторые мологжане отказались покинуть свои дома. После сооружения Рыбинской ГЭС и водохранилища, территория города была затоплена.
Долгие годы тема затопленного города Мологи была запретной. О ней не писали средства массовой информации, переселенцы-мологжане тоже вынуждены были молчать. Первые сохранившиеся фотографии встреч мологжан относятся к 1960-м годам. С этого времени каждую вторую субботу августа мологжане собирались в Рыбинске, чтобы отметить память своего погибшего города. Но даже в эти годы собираться приходилось вдали от родной земли — под Ленинградом. Только в июле 1972 года состоялась их первая встреча в Рыбинске. Вслух заговорили о Мологе только во второй половине 1980-х. Прошла серия статей, встречи стали публичными и переместились на Ярославскую землю. Теперь мологжане собираются в Рыбинске, чтобы символически «вернуться к родным берегам».
Уровень водохранилища колеблется, и приблизительно раз в два года Молога показывается из воды. Обнажаются мощение улиц, фундаменты домов, кладбище с надгробиями.
В 1992—1993 годах уровень Рыбинского моря понизился более чем на 1,5 метра, обнажив мостовые, улицы города, контуры фундаментов, кованые решётки, могильные плиты на кладбище. Прежде чем город-призрак вновь погрузился под воду, краеведам удалось собрать исторические реликвии для будущего музея Мологи, снять любительский фильм. Участники экспедиции высадились из катера прямо на торговую площадь, обошли почти все островки городской территории, протянувшейся когда-то на 4 километра над рекой Мологой. В их фильме звучат голоса людей, вернувшихся в свой город, узнающих белые ступени гимназии, ограду Афанасьевского женского монастыря, мощёную дорогу на кладбище, читающих имена на надгробных плитах…
В наше время в Рыбинске создан Музей Мологского края. По инициативе мологжан в июне 2003 года Администрацией Ярославской области был организован Круглый стол «Проблемы Мологского края и пути их решения». В своём выступлении академик В. И. Лукьяненко впервые выдвинул идею создания Национального парка «Молога» в память о затопленном городе.